正式官衔为总督福建，浙江二处地方提督军务、粮饟、管理河道兼巡抚事，是清朝九位最高级的封疆大臣之一，总管福建、浙江的军民政务。光绪十一年（1885）,清朝正式设立台湾省，命刘铭传为首任台湾巡抚,归闽浙总督管辖，至此闽浙总督统管福建、浙江、台湾三省军民政务。

历任总督

范承谟 盛京(今辽宁沈阳) 隶汉军镶黄旗

刘兆麒 顺天宝坻(今天津宁河)隶汉军

李之芳 山东武定

王骘 山东福山

钟音 顺天大兴(今北京) 隶满州镶蓝旗

喀尔吉善

 满洲正黄旗

李卫 江苏砀山(今属安徽)

郝玉麟 汉军镶白旗

嵇曾筠 江苏无锡

富勒浑 蒙古镶白旗

德沛

富明安 满洲镶红旗

苏昌 满洲正蓝旗

崔应阶 湖北江夏(今武汉)

纪晓岚 直隶献县(今属河北)

常青 满洲正蓝旗

觉罗长麟 满洲正蓝旗

高其倬 辽宁铁岭 雍正三年

杨廷璋 汉军镶黄旗 乾隆二十四年

程祖洛 安徽歙县 嘉庆十二年

方维甸 安徽桐城 嘉庆十四年

汪志伊 安徽桐城 嘉庆十六年

魏元烺 道光十一年辛卯（1831）

王懿德 河南祥符(今开封) 咸丰二年

庆瑞 咸丰八年

耆龄 满洲正黄旗 同治元年

左宗棠 湖南湘阴 同治二年

吴棠 安徽盱眙(今安徽明光) 同治五年

马新贻 山东菏泽 同治六年

李鹤年 奉天义州(今辽宁义县) 同治十年

文煜 满洲正蓝旗 光绪二年

何璟 广东香山(今中山) 光绪二年

杨昌浚 湖南湘乡 光绪十年

卞宝第 江苏仪征 光绪十四年

谭钟麟 湖南茶陵 光绪十八年

边宝泉 奉天辽阳(今属辽宁) 隶汉军镶红旗 光绪二十年

许应骙 广东番禺(今广州) 光绪二十四年

锡良 蒙古镶蓝旗 光绪二十九年

李兴锐 湖南浏阳 光绪二十九年

魏光焘 湖南隆回 光绪三十年

升允 蒙古镶蓝旗 光绪三十一年

崧蕃 满洲镶蓝旗 光绪三十一年

端方 满洲正白旗 光绪三十一年

周馥 安徽建德(今东至) 光绪三十二年

丁振铎 河南罗山 光绪三十二年

松寿 满洲正白旗 光绪三十三年

历史沿革

顺治二年，设立福建总督，总督府驻福州，兼管浙江。

顺治五年，改名为浙闽总督，总督府迁往衢州，仍兼管福建。

顺治十五年，两省各设总督，福建总督府驻漳州，浙江总督府驻温州。

康熙十年，将福建总督府迁往福州。次年，取消浙江总督。

康熙二十六年，福建总督更名福建浙江总督。

光绪十一年起，取消福建巡抚，由闽浙总督兼任。